El proyecto de decreto crea tres subcuentas para los pueblos indígenas en el Fondo para la Vida y la Biodiversidad: Subcuenta Indígena Nacional, Subcuenta Indígena Amazónica y Subcuenta Indígena de la Sierra Nevada de Gonawindúa (Santa Marta). Estas subcuentas agrupan recursos para implementar planes, programas y proyectos concertados con organizaciones indígenas, respetando sus planes de vida y particularidades culturales. La gobernanza incluye Comités de Direccionamiento Estratégico conformados por representantes indígenas, el Ministerio de Ambiente y el Fondo, para garantizar la participación, incidencia y decisión indígena en la gestión de recursos y proyectos. Los gastos operativos se cubrirán con la cuenta administrativa del Fondo, y las reglas específicas se adoptarán mediante reglamentos internos. Así se promueve la participación activa, el respeto a los derechos indígenas y la gestión sostenible de la biodiversidad.