La Autoridad Nacional de Licencias Ambientales (ANLA) ha asumido la competencia ambiental sobre la operación del Muelle 13 de Buenaventura desde el 18 de diciembre de 2024, anteriormente bajo la responsabilidad del Establecimiento Público Ambiental del Distrito de Buenaventura (EPA). Esta decisión se fundamenta en la clasificación del muelle como un puerto de gran calado, que moviliza más de 1.500.000 toneladas al año y permite el atraque de embarcaciones de 27 pies o más, según el Decreto 1076 de 2015. La ANLA emitió la Resolución 004 el 2 de enero de 2025, imponiendo una suspensión temporal de actividades debido a la falta de actualización del plan de manejo ambiental, lo que representa un riesgo ambiental significativo. La ANLA coordina acciones con el Ministerio de Ambiente y otras autoridades para garantizar el cumplimiento de la normativa ambiental y la protección del medio ambiente, mientras supervisa las condiciones ambientales del muelle durante la suspensión de actividades.